Destacado jugador del AS Monaco, con el que fue subcampeón de la Liga de Campeones 2003-04, y del FC Barcelona, con el que ha ganado la Liga española de fútbol 2004-05, la 2005-06 y la Liga de Campeones 2005-06. Extremo derecho de gran rapidez y habilidad en el desmarque y en el regate, pese a su pequeña estatura (1,64 metros de altura y 64 kg de peso).

Se inició como futbolista profesional en el equipo de su ciudad natal, el Olympique Lyonnais, de la mano del mítico futbolista francés Jean Tigana, que le dio la oportunidad de debutar en la primera división francesa con 18 años. Debutó en la Ligue 1 el 21 de enero de 1995 en el partido Olympique 3:1 Cannes. En el Olympique permaneció cuatro temporadas.

En 1997 fichó por el AS Monaco, al que había ido como entrenador Jean Tigana. En el equipo del Principado se consolidó definitivamente como uno de los mejores jugadores de Francia. Con este equipo conquistó una Liga y una Copa de la Liga. Además quedó subcampeón de la Liga de Campeones en la temporada 03-04, perdiendo la final ante el FC Porto, en la cual tuvo que retirarse antes de tiempo al lesionarse en la primera parte.

En junio de 2004 fichó por el FC Barcelona entrenado por Frank Rijkaard.1​ Debutó en la Primera división española el 29 de agosto de 2004 en el partido Racing de Santander 0:2 FC Barcelona, en el que Giuly marcó el primer gol de su equipo. Fue titular desde el principio y, aunque tuvo una lesión que bajó su rendimiento a mitad de temporada, acabó siendo uno de los jugadores fundamentales en la consecución del título de campeón de la Liga española de fútbol de la temporada 2004-2005. Además, Giuly, superó los 10 goles que prometió que marcaría al principio de temporada. Marcó un total de once tantos.

En la temporada 2005-2006 fue el héroe de las semifinales de la Liga de Campeones de la UEFA, cuando en el partido de ida disputado en San Siro contra el Milan marcó el único y decisivo gol de la elimitatoria, clasificando al Barcelona para la gran final. En la final disputada contra el Arsenal, el Barça se proclamó campeón y Giuly por fin lograba proclamarse vencedor de una final de Champions, después de no haberlo conseguido con el Mónaco. En dicha final, Giuly marcó un gol que no subió al marcador debido a un error del árbitro, que no concedió la ley de la ventaja en una falta del portero del Arsenal FC.2​ Semanas más tarde también conseguiría la segunda liga consecutiva para el equipo catalán.

Los medios de comunicación españoles coincidieron en señalar a Giuly como el primer jugador francés que triunfaba en la historia del FC Barcelona. Sin embargo, luego de hacer buenas actuaciones en el club catalán, se le ha vinculado con clubes de la talla del Celtic F. C., el Newcastle United y el Tottenham. La AS Roma también se interesa en él y, después de unas negociaciones con el FC Barcelona, el club azulgrana acepta una oferta por 4 millones el 17 de julio de 2007, pasando a ser nuevo jugador de la AS Roma.

Tras una temporada en el club romanista, donde acabó ganando una Supercopa de Italia, y la Copa de ese país, en 2008 pasa a formar parte del Paris Saint-Germain, al cual se compromete por tres temporadas.4​

En agosto del 2011, Giuly vuelve al AS Mónaco en una nueva etapa con el objetivo de ascender al equipo del principado a la Ligue 1, categoría que perdieron la temporada anterior.5​ Después de no lograr el objetivo, en julio de 2012 abandona la entidad y ficha por el Lorient.

1994–1998    Lyon    100    (21)
1998–2004    Monaco    184    (47)
2004–2007    Barcelona    85    (19)
2007–2008    Roma    32    (6)
2008–2011    Paris Saint-Germain    100    (16)
2011–2012    Monaco    27    (3)
2012–2013    Lorient    17    (1)
2013–2016    Monts d'Or Azergues    39    (16)
Total        584    (129).